La biblioteca de la Academia en un centro de información para investigadores en la disciplina de Historia y otras disciplinas afines.
Alberga unos 2,000 ejemplares bibliográficos nacionales, centroamericanos e internacionales.
Además cuenta con 1358 ejemplares hemerográficos (revistas de Historia y boletines de Academias de Historia iberoamericanas).
El acervo bibliográfico y hemerográfico esta distribuido en tres colecciones:
Colección Nacional Colección Centroamericana Colección Internacional
La biblioteca de la Academia también cuenta con una sección de archivos: -Catálogo digital Fuentes para la Historia salvadoreña -Catálogo digital Documentos para el estudio de la Independencia de Centroamérica -Archivo Oral de procesos y movimientos sociales, que a la fecha tiene en su acervo más de 600 registros entre entrevistas, testimonios y conferencias.
-Parte del archivo y biblioteca personal de general Francisco Menéndez (en proceso de organización y descripción). Papeles que fueron resguardados en la biblioteca personal del doctor Ritter Aislan, y que a su deceso, fueron donados por la esposa a la Academia.
-Copia de los documentos relativos al Partido Comunista Salvadoreño archivados por el Kominter, donados por el doctor Erik Ching, los cuales utilizó en su investigación Las masas, la matanza y el martinato, 1932. Documentos que muy pronto estarán puestos para su consulta desde el internet en el Catálogo fuentes para la Historia salvadoreña y centroamericana.
Todos los servicios que se prestan en la Academia son gratuitos. Entre estos se cuentan con:
Consulta de archivo oral
Consulta de biblioteca y hemeroteca
Servicio informático y consulta en internet
Muy pronto será publicado el catálogo de libros y material hemerográfico de la biblioteca de la Academia en el Catálaogo Fuentes para Historia salvadoreña y centroamericana.